Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKD3O94806 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRKD3O94806 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD3O94806 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms