Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC43A1O75387 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC43A1O75387 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 759.6 ms