Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNPHO15079 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNPHO15079 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNPHO15079 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNPHO15079 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNPHO15079 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNPHO15079 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNPHO15079 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNPHO15079 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNPHO15079 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNPHO15079 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNPHO15079 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNPHO15079 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNPHO15079 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNPHO15079 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNPHO15079 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNPHO15079 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNPHO15079 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNPHO15079 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNPHO15079 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNPHO15079 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNPHO15079 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNPHO15079 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNPHO15079 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNPHO15079 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNPHO15079 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNPHO15079 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNPHO15079 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNPHO15079 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNPHO15079 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNPHO15079 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNPHO15079 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNPHO15079 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNPHO15079 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNPHO15079 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNPHO15079 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNPHO15079 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNPHO15079 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNPHO15079 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms