Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KT08 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KT08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KT08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KT08 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KT08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KT08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KT08 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KT08 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KT08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KT08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KT08 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KT08 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KT08 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KT08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KT08 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KT08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
J3KT08 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3KT08 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3KT08 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3KT08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3KT08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3KT08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3KT08 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3KT08 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3KT08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KT08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KT08 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KT08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KT08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.02■□□□□ -0
J3KT08 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KT08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KT08 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KT08 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KT08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KT08 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KT08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KT08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KT08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KT08 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms