Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2564F6Z9S8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2564F6Z9S8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm2564F6Z9S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm2564F6Z9S8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2564F6Z9S8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm2564F6Z9S8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms