Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM1B2RUZ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM1B2RUZ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms