Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMED7Q9Y3B3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms