Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms