Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN3Q9UPQ7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms