Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF2Q9UNY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms