Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms