Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGA1Q9UJY5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms