Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms