Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH3Q9UHC1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms