Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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