Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCF20Q9UGU0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms