Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5BQ9UGL1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM5BQ9UGL1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms