Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPASTQ9UBP0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms