Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms