Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms