Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCM2LQ9NUG4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCM2LQ9NUG4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms