Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms