Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms