Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms