Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LHX9Q9NQ69 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms