Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP4F12Q9HCS2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms