Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSPNQ9HAW4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSPNQ9HAW4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms