Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms