Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms