Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms