Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSPO3Q9BXY4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms