Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC106Q9BWC9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms