Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDC1Q9BTX1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDC1Q9BTX1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms