Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms