Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms