Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPA33Q99795 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms