Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRBNQ96SW2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms