Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms