Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPS6KC1Q96S38 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms