Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms