Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms