Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PGAM5Q96HS1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PGAM5Q96HS1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PGAM5Q96HS1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGAM5Q96HS1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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