Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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