Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC51Q96ER9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC51Q96ER9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms