Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRUQ92729 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms