Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms