Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPBP1Q92547 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms