Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GIPC3Q8TF64 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GIPC3Q8TF64 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms