Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC9Q8NEP7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC9Q8NEP7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms