Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC17Q8N6Y2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms